No aquário, ocorrem basicamente as mesmas reações químicas e físicas que se pode observar no mar. A maior diferença, entretanto, é que por seus próprios meios o corpo aquático restrito de um aquário não é capaz de completar os ciclos que observamos no mar. O principal problema que encontraremos está relacionado ao acúmulo de subprodutos do metabolismo dos habitantes e da decoração do aquário. Como veremos adiante, existem maneiras de manter certas concentrações, como de nitratos e fosfatos, dentro de limites aceitáveis para que um aquário se desenvolva perfeitamente.
Nunca se deve esquecer, no entanto, que os meios que desenvolvemos para o controle desses problemas em potencial são artificiais (skimmer, carvão ativado, resinas filtrantes, etc.). Esses produtos e aparelhos têm por finalidade resolver certos problemas que fatalmente surgirão no decorrer da vida do aquário. Pode-se afirmar categoricamente que um aquário não tem como funcionar de maneira apropriada sem que se instale os seguintes sistemas:
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